Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm25145-201ENSMUST00000177640 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16329-201ENSMUST00000148174 371 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Apex1-201ENSMUST00000049411 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc6l2Q9JIM3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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