Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms