Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms