Protein–RNA interactions for Protein: Q9D035

Nkain1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain1Q9D035 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkain1Q9D035 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms