Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms