Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf144aQ925F3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf144aQ925F3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf144aQ925F3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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