Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms