Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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