Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms