Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms