Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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