Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms