Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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