Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms