Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
IfnkQ7TSL0 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms