Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms