Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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