Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms