Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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JrkQ60976 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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