Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bhlha9Q5RJB0 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms