Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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Rnf166Q3U9F6 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Ang-201ENSMUST00000069011 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rnf166Q3U9F6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rnf166Q3U9F6 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rnf166Q3U9F6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rnf166Q3U9F6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf166Q3U9F6 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms