Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms