Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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