Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Thbs3Q05895 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Thbs3Q05895 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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