Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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