Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Sec23aQ01405 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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