Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms