Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms