Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms