Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Mesp1P97309 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Mesp1P97309 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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Mesp1P97309 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Mesp1P97309 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Mesp1P97309 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Mesp1P97309 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Mesp1P97309 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Mesp1P97309 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Mesp1P97309 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Mesp1P97309 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Mesp1P97309 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Mesp1P97309 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Mesp1P97309 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Mesp1P97309 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms