Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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