Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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