Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms