Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd28P31041 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms