Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxraP28700 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RxraP28700 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RxraP28700 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RxraP28700 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RxraP28700 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RxraP28700 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RxraP28700 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RxraP28700 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RxraP28700 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RxraP28700 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
RxraP28700 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RxraP28700 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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