Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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