Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms