Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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