Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms