Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm44914-201ENSMUST00000207191 2720 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms