Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P10404 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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