Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms