Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms