Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Far1-211ENSMUST00000164745 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Dhx30-215ENSMUST00000198425 3968 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tom1l1-203ENSMUST00000107868 2093 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Wdhd1-202ENSMUST00000111792 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Polr3f-201ENSMUST00000028914 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Cdc25b-202ENSMUST00000079857 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Kcns3-203ENSMUST00000217974 2314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Lgals8-206ENSMUST00000135166 2416 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Synj2-205ENSMUST00000115786 2531 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ikbkap-201ENSMUST00000030140 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Kprp-201ENSMUST00000072363 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Lrrc28-201ENSMUST00000032775 1817 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm43318-201ENSMUST00000199939 1949 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Stx16-202ENSMUST00000087908 3865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC160405.2-201ENSMUST00000219008 1987 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Erich3-201ENSMUST00000051862 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Rab11fip3-201ENSMUST00000118828 3271 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Slc25a30-201ENSMUST00000022580 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Dhx30-203ENSMUST00000165596 3726 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Lcp1-202ENSMUST00000124499 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Utp14a-201ENSMUST00000080713 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms