Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms