Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf11E9PZM7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms