Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms