Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3298E9PW80 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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