Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms