Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms